福智佛教學院設有佛法應用研究所，以深入成佛道次第為主軸，開展佛法應用於關注、解決社會問題。未來將申辦實驗大學，針對當前教育日益僵化的教學方式提出實驗構想，福智實驗大學幸福人才培育實驗教育計畫，成立「慈心永續研究所」，包含慈悲教育、敬老照護、慈心農業、社區創新與心智健康等五個模組，以古坑國際心靈生態村為實踐場域，打造人人嚮往的身心靈健康與幸福人生的共創與共生聚落。
佛教學院與實驗大學雖依不同法源而設立，但兩者使用同一個校園，師資相互支援，共同構成福智的大學。
佛教學院佛法應用研究所
一個讓生命喜悅的學習園地
教育目標
人才＝讓自己和他人都能幸福
培養深入聞思修成佛道次第， 能安頓身心的研修人才。
培養具科學素養、文化底蘊， 能善巧應機的弘法人才。
培養具國際視野、跨域整合， 能運用佛法的領導人才。
核心素養
素養＝知識+態度+實修的全方位展現
思辨研修 -能認識成佛道次第及儒家聖賢之道，並具有深入思辯及學術研究的思辨力。
自重自律 -能結合心續，依業果正見，具備戒行持犯、克己復禮與善行實踐的自律力。
跨域融通 -具有國際視野，能多元跨域、自主學習，從事領導、整合與研發的跨域力。
虔誠恭敬 -調伏內心，能使自他生起對三寶虔誠信仰，恭敬師長、孝順父母的調心力。
正念正知 -專注當下，能守護身語意，不忘失行善及所持戒律，對惡念惡行有警覺力。
和合領導 -以德服人，能慈悲智慧領導，解決各項事業問題、創造自他幸福的和合力。
課程規劃
智慧＝洞悉宇宙人生真理、如理抉擇
「佛法底蘊」課程
以不散亂心、正思法義，輔以方法論之架構課程，聞思修貫串修學，落實「一切聖言現為教授」。
「佛法對話」課程
透過佛法與東西方文明重要脈絡的跨文化對話與思辨，探究當代心靈的實踐環境和意義脈絡。
「佛法應用」課程
開設幸福企業、儒家修身、止觀應用、心靈科學等系列應用專題，讓佛法應用與幸福傳遞遍地開花。
「佛法底蘊」課程
以不散亂心、正思法義，輔以方法論之架構課程，聞思修貫串修學，落實「一切聖言現為教授」。
「佛法對話」課程
透過佛法與東西方文明重要脈絡的跨文化對話與思辨，探究當代心靈的實踐環境和意義脈絡。
「佛法應用」課程
開設幸福企業、儒家修身、止觀應用、心靈科學等系列應用專題，讓佛法應用與幸福傳遞遍地開花。
打造幸福人才
快樂＝醒覺的心+關注社會+專業利他
佛法底蘊課程認識自己，培養正知正念，提升自覺力，創造自他幸福。 國際視野、跨文化對話，增進理解、交流共享，創造心靈實踐的意義。
學生中心、議題導向、思辨探索，清晰問題意識，師生團隊共創價值。 做中學、做中研，深化專業，投入心靈生態村，探究解決社會的問題。
佛法底蘊課程認識自己，培養正知正念，提升自覺力，創造自他幸福。 國際視野、跨文化對話，增進理解、交流共享，創造心靈實踐的意義。